解剖同源性是不同种类的植物或动物之间的形态学或生理学相似性。 比较解剖学是解剖学同源性的研究，是进化和共同下降的大多数传统证据的来源。 解剖同源性继续提供物种之间深层关系的许多例子，这些物种是最好的或仅通过进化理论解释，当相似性从功能的角度来看根本没有意义时。
如果物种独立出现（自然地或通过神圣的行为），每个生物体应具有独特地适合其性质和环境的特征。 也就是说，生物体的解剖结构将以最适合其特定生活方式的方式起作用。 然而，如果物种进化，那么它们的解剖结构受到其祖先能够提供的任何限制。 这意味着他们将缺少一些非常适合他们生活方式的功能，并且他们将拥有其他不那么有用的功能。
完美创造与不完美进化
虽然创造论者喜欢谈论生活是如何“完美”设计的，但事实是，当我们环顾自然界时，我们并没有发现这一点。 相反，我们发现植物和动物的种类可能在其他地方的其他物种中发现的解剖学特征方面做得更好，并且与解剖学特征有关，这些特征似乎与过去或现在的其他物种有关。 这些同源性有无数例子。
一个经常被引用的例子是四足动物的五指（五位）肢体（具有四肢的脊椎动物，包括两栖动物，爬行动物，鸟类和哺乳动物）。 当你考虑所有这些生物的各种肢体（抓握，行走，挖掘，飞行，游泳等）的功能大不相同时，所有这些肢体都没有功能性原因具有相同的基本结构。 人类，猫，鸟和鲸为什么都有相同的基本五位肢体结构？ （注意：成年鸟有三位数的四肢，但胚胎上这些数字来自五位数的前体。）
唯一有意义的想法是，所有这些生物都是从一个共同的祖先发展而来，恰好有五位肢体。 如果你检查化石证据，这个想法得到进一步支持。 来自泥盆纪时期的化石，当四足动物被认为已经发育时，显示了六位，七位和八位四肢的例子 - 所以它并不像五位肢体有一些限制。 确实存在四肢上有不同数字位数的四肢生物。 同样，唯一有意义的解释是，所有的四足动物都是从一个共同的祖先发展而来，恰好有五位肢体。
有害的同源性
在许多同源性中，物种之间的相似性在任何明显的方面都不是主动不利的。 从功能的角度来看，它可能没有意义，但它似乎并没有损害有机体。 另一方面，一些同源性确实看起来确实是不利的。
一个例子是颅神经通过心脏附近的管从大脑到喉部。 在鱼类中，这条路径是直接的路径。 有趣的是，这种神经在所有具有同源神经的物种中遵循相同的途径。 这意味着在像长颈鹿一样的动物身上，这种神经必须从大脑向下绕颈部进行一次荒谬的绕行，然后将颈部向颈部恢复到喉部。
因此，与直接连接相比，长颈鹿必须增长10-15英尺的神经。 这种经常发生的喉返神经明显效率低下。 如果我们接受长颈鹿从类似鱼类的祖先进化而来，很容易解释为什么神经采取这种迂回的路线。
另一个例子是人类膝盖。 如果一个生物大部分时间都在地上行走，那么向后铰接的膝盖要好得多。 当然，如果你花很多时间爬树，前向关节膝盖是很好的。
合理化不完美的创作
为什么长颈鹿和人类如果独立起源会有如此糟糕的配置，这仍然是创造论者需要解释的东西。 最常见的创造论者反驳任何类型的同源词经常是“上帝根据某种模式创造了所有生物，这就是为什么不同物种表现出相似性”的多样性。
如果是这样的话，忽略了我们必须认为上帝是一个非常差的设计师的观点，这个解释根本就不是解释。 如果创造论者要声称某些计划存在，则由他们来解释该计划。 否则只是一种来自无知的论证，相当于说事情是他们“仅仅因为”的方式。
鉴于证据，进化解释更有意义。
